MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012131	AAAAG	2	10	372	381	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012131	AGAAA	2	10	626	635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012131	A	7	7	644	650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012131	AT	3	6	3922	3927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012131	AACTA	2	10	3939	3948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012131	TA	3	6	3947	3952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012131	TAA	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012131	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012131	TAA	2	6	4640	4645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012131	ATT	2	6	4646	4651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012131	TTA	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012131	TTAAAT	2	12	4711	4722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012131	AT	3	6	4818	4823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012131	A	6	6	4848	4853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012131	ACAA	2	8	4889	4896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012131	A	6	6	4900	4905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012131	AGC	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012131	TAC	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012131	T	7	7	4942	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012131	T	6	6	5019	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012131	TTAC	2	8	5030	5037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012131	AAT	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012131	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012131	TAA	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012131	AAT	3	9	5122	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012131	A	6	6	5132	5137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012131	TTTAA	2	10	5214	5223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012131	CCT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012131	TAT	2	6	5733	5738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012131	TAA	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012131	A	6	6	5766	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012131	AAC	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012131	T	6	6	5822	5827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012131	T	6	6	6042	6047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012131	T	7	7	6084	6090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012131	T	6	6	6106	6111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012131	ACA	2	6	6390	6395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012131	ATA	2	6	6399	6404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012131	T	7	7	6422	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012131	TAA	2	6	6477	6482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012131	TTACTT	2	12	6536	6547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012131	AT	3	6	7566	7571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012131	TGC	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012131	A	6	6	7662	7667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012131	TTA	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012131	TTTTA	2	10	7716	7725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012131	AAT	2	6	7728	7733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012131	CCT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012131	ATT	2	6	7757	7762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012131	T	7	7	7761	7767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012131	T	6	6	7770	7775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012131	ATC	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012131	AATTTT	2	12	7982	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012131	T	7	7	8020	8026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012131	A	7	7	8075	8081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012131	CAACTC	2	12	8173	8184	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012131	CAA	2	6	8187	8192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012131	TAA	2	6	8196	8201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012131	ATT	2	6	8218	8223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012131	CAT	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012131	T	8	8	8246	8253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012131	A	8	8	8767	8774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012131	GTTT	2	8	8862	8869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012131	CCT	2	6	9105	9110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012131	TA	3	6	9132	9137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012131	A	6	6	9163	9168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012131	TTA	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012131	TAA	2	6	9204	9209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012131	ATTT	2	8	9228	9235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012131	A	7	7	9236	9242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012131	TTA	2	6	9306	9311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012131	A	6	6	9315	9320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012131	TAC	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012131	ATT	2	6	9357	9362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012131	ATA	2	6	10373	10378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012131	CCT	2	6	12783	12788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012131	TAA	2	6	12802	12807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012131	TAT	2	6	12812	12817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012131	A	6	6	12854	12859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012131	ATT	2	6	12872	12877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012131	CTACA	2	10	12937	12946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_012131	ATT	2	6	13123	13128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012131	AGG	2	6	13144	13149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012131	ATA	2	6	13172	13177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012131	AAATT	2	10	13187	13196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012131	C	6	6	14124	14129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_012131	TTG	2	6	14158	14163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012131	CCG	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012131	A	6	6	14531	14536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012131	ATA	2	6	14545	14550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012131	T	6	6	14577	14582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012131	A	6	6	14610	14615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012131	A	6	6	14657	14662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012131	TGT	2	6	14701	14706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012131	ATT	3	9	14722	14730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012131	ATT	2	6	14771	14776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012131	ATT	2	6	14789	14794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012131	AGA	2	6	14819	14824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012131	A	7	7	14826	14832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012131	TGA	3	9	14880	14888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012131	ATAAA	2	10	14909	14918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012131	T	7	7	15293	15299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012131	TGT	2	6	15301	15306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012131	TAAT	2	8	15318	15325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012131	TA	3	6	15359	15364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012131	ATT	2	6	15417	15422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012131	GAA	2	6	15459	15464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012131	AT	3	6	15468	15473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012131	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012131	TAC	2	6	15638	15643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012131	AGAT	2	8	15646	15653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012131	AGA	2	6	15661	15666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012131	ATAG	2	8	15681	15688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012131	A	6	6	15738	15743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012131	TAA	2	6	15755	15760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012131	ATT	2	6	15764	15769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012131	AAT	2	6	15797	15802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012131	TAG	3	9	15817	15825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012131	TAT	2	6	15842	15847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012131	AAC	2	6	15848	15853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012131	TGT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012131	A	6	6	15898	15903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012131	T	6	6	15990	15995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012131	A	6	6	16023	16028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012131	AT	3	6	16052	16057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012131	T	6	6	16069	16074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012131	CGG	2	6	16408	16413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012131	AATTT	2	10	17407	17416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012131	ATT	2	6	17427	17432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012131	CCT	2	6	17454	17459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012131	AAT	2	6	17475	17480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012131	A	7	7	17528	17534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012131	CT	3	6	17551	17556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012131	AGGT	2	8	17616	17623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012131	TGTAG	2	10	17656	17665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012131	TATTAA	2	12	17715	17726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012131	TAA	2	6	17733	17738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012131	T	6	6	17752	17757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012131	ATT	2	6	17803	17808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012131	AGG	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012131	TTA	2	6	20229	20234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012131	TAAA	2	8	20238	20245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012131	AAT	2	6	20795	20800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012131	A	6	6	20833	20838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012131	TTC	2	6	20886	20891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012131	AAT	2	6	21246	21251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012131	AGT	2	6	21273	21278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012131	T	6	6	21288	21293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012131	ATA	2	6	21296	21301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012131	ATTTT	2	10	21304	21313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012131	ATTTTT	2	12	21359	21370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012131	T	7	7	21366	21372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012131	AAAT	2	8	21373	21380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012131	TTA	2	6	21399	21404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012131	TAA	2	6	21411	21416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012131	TAT	2	6	21435	21440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012131	T	7	7	21440	21446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012131	TA	3	6	21471	21476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012131	ATT	2	6	21477	21482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012131	AGG	2	6	21498	21503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012131	AAAC	2	8	21739	21746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_012131	T	8	8	21834	21841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012131	A	8	8	22355	22362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012131	ATA	2	6	22386	22391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012131	TTA	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012131	TTG	2	6	22416	22421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012131	GTA	2	6	22430	22435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012131	G	6	6	22457	22462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012131	GAG	2	6	22549	22554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012131	ACTAAA	2	12	22854	22865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_012131	A	6	6	22863	22868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012131	A	7	7	22871	22877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012131	GGA	2	6	22890	22895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012131	T	6	6	23296	23301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012131	AGA	2	6	23331	23336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012131	TGGC	2	8	23414	23421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
179	NC_012131	T	6	6	23685	23690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012131	TAA	2	6	23714	23719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_012131	TTA	2	6	23797	23802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012131	GTT	2	6	23848	23853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012131	TA	3	6	23891	23896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012131	T	6	6	23924	23929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012131	T	6	6	23943	23948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012131	T	6	6	23955	23960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012131	ATTTT	2	10	23964	23973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012131	ACT	2	6	23979	23984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_012131	A	6	6	24012	24017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012131	ATT	2	6	24047	24052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_012131	AAGTAA	2	12	24096	24107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012131	ATA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_012131	AT	3	6	24275	24280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012131	AATTT	2	10	24295	24304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012131	T	6	6	24356	24361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012131	ATTA	2	8	24419	24426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012131	A	6	6	24438	24443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012131	ATT	2	6	24449	24454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012131	GT	3	6	24456	24461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
200	NC_012131	GGAGTA	2	12	24483	24494	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_012131	A	6	6	25178	25183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012131	A	6	6	25195	25200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_012131	GTT	2	6	25209	25214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_012131	ATTA	2	8	25241	25248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_012131	AAAAG	2	10	25249	25258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_012131	TAA	2	6	25378	25383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.